RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTSHP09668 335 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXD13P35453 343 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEX3P56589 373 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTK7Q13308 1070 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALCAMQ13740 583 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP4Q96MN2 994 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS16Q9H269 839 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GINS2Q9Y248 185 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THPOP40225 353 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAAP100Q0VG06 881 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAPSQ13938 189 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIZQ2M2Z5 673 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX33O43247 280 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R37O75864 691 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TPM2P07951 284 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PBX1P40424 430 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STRA6Q9BX79 667 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LGALS16A8MUM7 142 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ESPNB1AK53 854 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 K7ENM7 598 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPTX2P47972 431 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPC3P51654 580 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF149Q8NC42 400 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOX2Q96NM4 488 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIP14410 1827 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A087WZ62 844 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC169A6NNP5 214 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNA14O95837 355 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFT74Q96LB3 600 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CETN3O15182 167 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC16A4O15374 487 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPR32O75388 356 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCKAP1LP55160 1127 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP7Q8WX94 980 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCLT1Q96NL6 688 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRNA1P02708 482 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CKBP12277 381 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNA1Q09470 495 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAM9Q13443 819 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NFIL3Q16649 462 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPN21Q16825 1174 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RSPH3Q86UC2 560 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NME8Q8N427 588 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSMRQ99650 979 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NR2F2P24468 414 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBXN1Q04323 297 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAN2A1Q16706 1144 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPAINQ86UA6 219 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.27■■□□□ 1.16
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