RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 STK39Q9UEW8 545 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 IRAK3Q9Y616 596 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ZXDAP98168 799 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ITIH3Q06033 890 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 GBP3Q9H0R5 595 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ZBP1Q9H171 429 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 RSAD1Q9HA92 442 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TECTAO75443 2155 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ERLIN2O94905 339 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ALDH2P05091 517 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CTSAP10619 480 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 AXLP30530 894 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 POU5F1BQ06416 359 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TFDP1Q14186 410 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 NEMFO60524 1076 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 DGAT1O75907 488 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 TXKP42681 527 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 SLC11A1P49279 550 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 PTENP60484 403 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 UBXN11Q5T124 520 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 NR2E1Q9Y466 385 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM221A6NGB7 291 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 M0R296 226 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 JAK2O60674 1132 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC51Q96ER9 411 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 DDHD2O94830 711 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ITGA4P13612 1032 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 MTHFRP42898 656 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 FOSBP53539 338 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 NOTUMQ6P988 496 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR9Q96QG7 549 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ARL2P36404 184 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ARID2Q68CP9 1835 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 TSPAN1O60635 241 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 POMCP01189 267 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 RARRES1P49788 294 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 FBXL18Q96ME1 805 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 IPPQ9Y573 584 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 WNT7AO00755 349 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 NRP1O14786 923 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 B4GALT3O60512 393 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN21Q16825 1174 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB33Q86T24 672 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 HACE1Q8IYU2 909 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 CSRNP2Q9H175 543 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 POMKQ9H5K3 350 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.39■■□□□ 1.34
NEDD8-201ENST00000250495 EPCAMP16422 314 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-201ENST00000250495 ATP2B1P20020 1258 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-201ENST00000250495 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-201ENST00000250495 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-201ENST00000250495 CAPSQ13938 189 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN14Q15678 1187 aa23.39■■□□□ 1.33
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