RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 AKR1A1P14550 325 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 BMP8BP34820 402 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 CDK7P50613 346 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 GJA9P57773 515 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 GNG11P61952 73 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 KCNMA1Q12791 1236 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 KCNH2Q12809 1159 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 SPA17Q15506 151 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ODR4Q5SWX8 454 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 BORCS6Q96GS4 357 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ACCSQ96QU6 501 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 DNAI1Q9UI46 699 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 USP20Q9Y2K6 914 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 SAMM50Q9Y512 469 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0C4DFX4 3053 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 PTPRSQ13332 1948 aa11.66□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ATP8B3O60423 1300 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 DGAT1O75907 488 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 RGS20O76081 388 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 PRLRP16471 622 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 RFX1P22670 979 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 EDNRBP24530 442 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 HOXD13P35453 343 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 NKX3-2P78367 333 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 CETN1Q12798 172 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 NEDD9Q14511 834 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 HIC1Q14526 733 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 XKR3Q5GH77 459 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 USP37Q86T82 979 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF592Q92610 1267 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA3-201ENST00000229265 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.65□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 PJA2O43164 708 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 CHMP2AO43633 222 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 SORBS3O60504 671 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 MSCO60682 206 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 ATP9AO75110 1047 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 HIP1RO75146 1068 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 SERPING1P05155 500 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 KCNA2P16389 499 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 NCKAP1LP55160 1127 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 MAPK7Q13164 816 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 TCTN1Q2MV58 587 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 GBP6Q6ZN66 633 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 TET1Q8NFU7 2136 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 BAP1Q92560 729 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 FAM81BQ96LP2 452 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 CHP1Q99653 195 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 TBX21Q9UL17 535 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 CTAGE9A4FU28 777 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 KBTBD13C9JR72 458 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 MYBP10242 640 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 TNFAIP2Q03169 654 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 KIF5AQ12840 1032 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 PDXDC1Q6P996 788 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 TLK2Q86UE8 772 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA3-201ENST00000229265 CEP112Q8N8E3 955 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms