RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 LxnP70202 222 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 rp9P97762 213 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp9bP98195 1146 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tfdp1Q08639 410 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ttc39dQ0VF76 604 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tcerg1lQ3B807 590 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf827Q505G8 1078 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Xkr4Q5GH67 647 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp13a4Q5XF90 1193 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gas8Q60779 478 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 NntQ61941 1086 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sycp1Q62209 993 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nacc1Q7TSZ8 514 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dnph1Q80VJ3 173 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf784Q8BI69 297 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pdcl3Q8BVF2 240 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 GlmnQ8BZM1 596 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rps6ka5Q8C050 863 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Scyl2Q8CFE4 930 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trim32Q8CH72 655 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gtpbp10Q8K013 366 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dlk2Q8K1E3 382 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gga1Q8R0H9 635 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Klhl36Q8R124 613 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ap3m2Q8R2R9 418 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plekha4Q8VC98 588 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vps36Q91XD6 386 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chst12Q99LL3 419 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trmt10bQ9D075 318 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Msgn1Q9JK54 188 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Limd1Q9QXD8 668 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Spint1Q9R097 507 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ank3G5E8K5 1961 aa7.7□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mllt6B1AR10 1109 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc152E9PX14 254 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Svs3aF2Z472 265 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Farp1F8VPU2 1048 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prl6a1O35257 230 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tnfrsf11aO35305 625 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MsnP26041 577 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tnni3P48787 211 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccr1P51675 355 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adcy7P51829 1099 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nploc4P60670 608 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 NfiaQ02780 532 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ptgs2Q05769 604 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dpcr1Q3TNW5 500 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr70Q3TWF6 657 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MaeaQ4VC33 396 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 DeptorQ570Y9 409 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc42Q5SV66 316 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lamb3Q61087 1168 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Shc3Q61120 474 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cln3Q61124 438 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 LbpQ61805 481 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tpd52Q62393 224 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ntan1Q64311 310 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Styk1Q6J9G1 429 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mcph1Q7TT79 822 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 RragaQ80X95 313 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ece2Q80Z60 881 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aoc2Q812C9 757 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc169Q8BXX9 214 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Psmd6Q99JI4 389 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Card14Q99KF0 999 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Htra3Q9D236 459 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sertad2Q9JJG5 309 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr81Q5ND34 1934 aa7.69□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Osbpl7A2A716 963 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gcom1E9PZ54 550 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm10801F7C7Q0 168 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PtenO08586 403 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mdm4O35618 489 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nck2O55033 380 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 StrnO55106 780 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aoc3O70423 765 aa7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Men1O88559 611 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PtprcP06800 1291 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90.3 ms