RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankef1Q9D2J7 775 aa19.81■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sdr42e1Q9D665 394 aa19.81■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmod3Q9JHJ0 352 aa19.81■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klra10Q9R1G6 266 aa19.81■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arih1Q9Z1K5 555 aa19.81■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 StrnO55106 780 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pola2P33611 600 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ano9P86044 747 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc85aQ5SP85 500 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tlr13Q6R5N8 991 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gja6Q6S5G4 283 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sass6Q80UK7 654 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phtf2Q8CB19 747 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Frat2Q8K025 231 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Creld2Q9CYA0 350 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc7Q9QYI3 494 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hs6st3Q9QYK4 470 aa19.8■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cnbd1B1AWM0 430 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hoxb13P70321 286 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mark2Q05512 776 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Agxt2Q3UEG6 513 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nxf2Q4ZGD8 691 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ces5aQ6AW46 575 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q8BGN9 141 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Scyl2Q8CFE4 930 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Desi2Q9D291 194 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Drc3Q9D5E4 523 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxo16Q9QZM9 334 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slfn14V9GXG1 899 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arid2E9Q7E2 1828 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Apol6B7ZC55 329 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc152E9PX14 254 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8298J3QPI0 401 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PrkcshO08795 521 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mmp15O54732 657 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tcerg1lQ3B807 590 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Avpr1aQ62463 423 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mbtd1Q6P5G3 631 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PhkbQ7TSH2 1085 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankfy1Q810B6 1169 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LppQ8BFW7 613 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd54Q91WK7 299 aa19.79■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Guca2bO09051 106 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RaraP11416 462 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp11b1Q3TG86 501 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tp53i13Q5F267 385 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klra7Q60654 280 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cd180Q62192 661 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phlda1Q62392 405 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hdac10Q6P3E7 666 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Epn1Q80VP1 575 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc15a5Q8CBB2 566 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stap2Q8R0L1 411 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Smyd3Q9CWR2 428 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Polr3eQ9CZT4 710 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PrameQ9D4Z5 464 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fthl17aQ9DAX0 182 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 FignQ9ERZ6 759 aa19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm13084A2A8N0 494 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sec14l1A8Y5H7 715 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nr1i3O35627 358 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Calb1P12658 261 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mief2Q5NCS9 454 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Snx17Q8BVL3 470 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 VcpkmtQ8C436 228 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnf208Q8K0W3 265 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spata4Q8K3V1 295 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Morc1Q9WVL5 950 aa19.77■□□□□ 0.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gcom1E9PZ54 550 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm9268E9Q0M3 861 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r62K7N712 859 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kpna6O35345 536 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hoxc8P09025 242 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tbx3P70324 741 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MyzapQ3UIJ9 466 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ntan1Q64311 310 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mapk15Q80Y86 549 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam49aQ8BHZ0 323 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pi4kbQ8BKC8 816 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Amer2Q8CCJ4 672 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf131Q8K3J5 619 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klhl20Q8VCK5 604 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam111aQ9D2L9 613 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ripk3Q9QZL0 486 aa19.76■□□□□ 0.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chrna1P04756 457 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms