RNA–Protein interactions for RNA: YOR353C

SOG2, Transcript of Key component of the RAM signaling network, yeast

Gene SOG2, Length 2,376 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOG2	YOR353C	SUA5	P32579	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	PTC1	P35182	281 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	PEP8	P40335	379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	UFD1	P53044	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	GTR2	P53290	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	SLI1	P53304	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	NUP53	Q03790	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	PSY3	Q12318	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	MHT1	Q12525	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	TOP3	P13099	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	URA6	P15700	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	PDX1	P16451	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	NPR1	P22211	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	ATG15	P25641	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	PEX3	P28795	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	CTS1	P29029	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	SDH3	P33421	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	APT2	P36973	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	FKH2	P41813	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	IRC7	P43623	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	SPT20	P50875	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YGR026W	P53217	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	CSN9	Q03981	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	APC4	Q04601	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	MCH5	Q08777	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	COS2	P0CX12	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	COS3	P0CX13	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	TRX3	P25372	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YJL068C	P40363	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	IDP2	P41939	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	BIO3	P50277	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YGL204C	P53089	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	MRPL19	P53875	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YNL140C	P53910	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	FEX1	Q08913	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	DFG16	Q99234	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOG2	YOR353C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YIM1	P28625	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
SOG2	YOR353C	MTH1	P35198	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MET28	P40573	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MTQ1	P53944	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MFG1	Q07684	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	AI1	P03875	834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	STP22	P25604	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	BZZ1	P38822	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	TIM21	P53220	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	DIA1	P54005	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	GPB1	Q08886	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	INP53	Q12271	1107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	COX17	Q12287	69 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RPN13	O13563	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	BET3	P36149	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	AIM29	P36154	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RIM2	P38127	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	BNA4	P38169	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
SOG2	YOR353C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YJL206C	P39529	758 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	IMA1	P53051	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	TNA1	P53322	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	TIM10	P87108	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SMA2	Q04658	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	BUR2	Q05949	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RHO2	P06781	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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