RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC43	Q8N309	656 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CASD1	Q96PB1	797 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PP2D1	A8MPX8	630 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRM6	O15303	877 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF623	O75123	536 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSPG5	O95196	566 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYT1	P21579	422 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC25A	P30304	524 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP2R5A	Q15172	486 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL17A	Q16552	155 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	LONRF3	Q496Y0	759 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOTUM	Q6P988	496 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNNM3	Q8NE01	707 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNX21	Q969T3	373 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFT74	Q96LB3	600 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.37	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	EYA4	O95677	639 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ECM1	Q16610	540 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARID2	Q68CP9	1835 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASB2	Q96Q27	587 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035		E9PMD0	336 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGB1	P05556	798 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBA7	P41226	1012 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT17	Q04695	432 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	HACE1	Q8IYU2	909 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	URGCP	Q8TCY9	931 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	POF1B	Q8WVV4	589 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIFAP3	Q92845	792 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	LPP	Q93052	612 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC51	Q96ER9	411 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	AK8	Q96MA6	479 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF558	Q96NG5	402 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CWH43	Q9H720	699 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF19A	Q9NV58	838 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		18.35	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCK2	O43639	380 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSPAN1	O60635	241 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	FGF18	O76093	207 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE3A	Q05086	875 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CALML4	Q96GE6	196 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CPB2	Q96IY4	423 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		18.33	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CARNS1	A5YM72	827 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGA4	P13612	1032 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	LIG1	P18858	919 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPM1A	P35813	382 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAMPT	P43490	491 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TFF2	Q03403	129 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAPK6	Q16659	721 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CABP7	Q86V35	215 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLIN2	Q99541	437 aa		18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSRNP2	Q9H175	543 aa		18.33	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms