RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH8Q5T0T0 291 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MTHFD1LQ6UB35 978 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM59Q8IWR1 403 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 RAET1EQ8TD07 263 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP4P49662 377 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCN3P51790 818 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN1Q04323 297 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD10Q14728 455 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL13Q8N6R0 699 aa27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-215ENST00000628018 MYADML2A6NDP7 307 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 RRN3P2A6NIE6 340 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 TISP43B9A030 160 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ASAP2O43150 1006 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 KPNA6O60684 536 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 RARBP10826 455 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PSEN2P49810 448 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PRMT2P55345 433 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 NDST4Q9H3R1 872 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ITIH6Q6UXX5 1313 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD63C9JTQ0 380 aa27.26■■□□□ 1.96
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CAPNS1-215ENST00000628018 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
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CAPNS1-215ENST00000628018 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 EVPLQ92817 2033 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 NRCAMQ92823 1304 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQC6 194 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ERI5 159 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2J2P51589 502 aa27.26■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 STRN3Q13033 797 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 BORCS6Q96GS4 357 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 CBWD1Q9BRT8 395 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 SPC25Q9HBM1 224 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 SETD4Q9NVD3 440 aa27.26■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMOD1P28289 359 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 ADSSP30520 456 aa27.25■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 PGK1P00558 417 aa27.24■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM186BQ8IYM0 893 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC113Q9H0I3 377 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC3O60645 756 aa27.23■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP15Q5T1M5 1219 aa27.23■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa27.23■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP4BP1P59074 171 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R3AQ06190 1150 aa27.22■■□□□ 1.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 BICD1Q96G01 975 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 ERGIC2Q96RQ1 377 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 BEGAINQ9BUH8 593 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 NFKBIZQ9BYH8 718 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 TSKSQ9UJT2 592 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 GARTP22102 1010 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 PTENP60484 403 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM17P78536 824 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 ARID5BQ14865 1188 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP4Q96MN2 994 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.21■■□□□ 1.95
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