RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 EMC2Q15006 297 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 EPHA7Q15375 998 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF410Q86VK4 478 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 SUSD6Q92537 303 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 FAM122AQ96E09 287 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 FAM20AQ96MK3 541 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 GBP3Q9H0R5 595 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 SPG21Q9NZD8 308 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 LZTS1Q9Y250 596 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 HOXA2O43364 376 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 OFD1O75665 1012 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 SLITRK3O94933 977 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ALADP13716 330 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ANAPC15P60006 121 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 XKR9Q5GH70 373 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 TMC7Q7Z402 723 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 DDHD2O94830 711 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 EOMESO95936 686 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 CA8P35219 290 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 SLC11A1P49279 550 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 DNM2P50570 870 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 C4orf19Q8IY42 314 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 ZBP1Q9H171 429 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 CHST12Q9NRB3 414 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 DACT1Q9NYF0 836 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-231ENST00000600201 POTEMA6NI47 508 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 F8W810 466 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TBX3O15119 743 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 NEK4P51957 841 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 FERMT3Q86UX7 667 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TPH2Q8IWU9 490 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 RNF149Q8NC42 400 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CPB2Q96IY4 423 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 RNF39Q9H2S5 420 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TRIP11Q15643 1979 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 MARCH6O60337 910 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 GALTP07902 379 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 EPCAMP16422 314 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 XBP1P17861 261 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 PPM1AP35813 382 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 VPS52Q8N1B4 723 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 HES2Q9Y543 173 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 B4GALT5O43286 388 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TSPAN1O60635 241 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 POMCP01189 267 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 ATP2B1P20020 1258 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 RFC5P40937 340 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 TXKP42681 527 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CAPSQ13938 189 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 ANKRD1Q15327 319 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CALCRLQ16602 461 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 AMHR2Q16671 573 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms