RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PLXNA3P51805 1871 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 M0R2N6 131 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF623O75123 536 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 OFD1O75665 1012 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GALTP07902 379 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 WEE2P0C1S8 567 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 EPCAMP16422 314 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMA5P28066 241 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB27AP51159 221 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 LONRF3Q496Y0 759 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MBOAT7Q96N66 472 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DMDP11532 3685 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GFRA3O60609 400 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ASGR2P07307 311 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMC5P62195 406 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NPY5RQ15761 445 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KANK3Q6NY19 840 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ANO5Q75V66 913 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KSR1Q8IVT5 923 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 BLIDQ8IZY5 108 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NLRP4Q96MN2 994 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJB4Q9UDY4 337 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 USTQ9Y2C2 406 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 H0Y858 1186 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 B4GALT3O60512 393 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DEXIO95424 95 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC11A1P49279 550 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPN14Q15678 1187 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT17Q6IS24 598 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 RUFY3Q7L099 469 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CABP7Q86V35 215 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PGBD4Q96DM1 585 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PROB1E7EW31 1015 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 EML1O00423 815 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC37A4O43826 429 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 REC8O95072 547 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NPEPPSP55786 919 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2R5CQ13362 524 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 URGCPQ8TCY9 931 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 AIFM3Q96NN9 605 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GBP3Q9H0R5 595 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 STK39Q9UEW8 545 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 VAV3Q9UKW4 847 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ARID2Q68CP9 1835 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CPLX1O14810 134 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DDHD2O94830 711 aa11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms