RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CA8	P35219	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	DNM2	P50570	870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	HAS1	Q92839	578 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CASP10	Q92851	521 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	OFD1	O75665	1012 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	POTED	Q86YR6	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CXCL14	O95715	111 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	GALT	P07902	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	EPCAM	P16422	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SLC11A1	P49279	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	LXN	Q9BS40	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ZBTB39	O15060	712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF623	O75123	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CTSA	P10619	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	RAB27A	P51159	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TCF15	Q12870	199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	EMC2	Q15006	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PFKFB2	O60825	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CDKL5	O76039	1030 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	DDHD2	O94830	711 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	LARGE1	O95461	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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