RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM105AQ9NUU6 356 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNA5P22460 613 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNQ1P51787 676 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 UBE3AQ05086 875 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 POU5F1BQ06416 359 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 POTEGQ6S5H5 508 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 GLB1LQ6UWU2 654 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF558Q96NG5 402 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 FGF18O76093 207 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 AXLP30530 894 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PPM1AP35813 382 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ARL2P36404 184 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PRPHP41219 470 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PTENP60484 403 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 KRT17Q04695 432 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 LONRF3Q496Y0 759 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CLLU1OSQ5K130 101 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 KRT79Q5XKE5 535 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 IGFLR1Q9H665 355 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CWH43Q9H720 699 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 MINDY3Q9H8M7 445 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CLDND1Q9NY35 253 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CARNS1A5YM72 827 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRIQ4A6NIV6 560 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF623O75123 536 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 BMP1P13497 986 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PDCP20941 246 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CAPSQ13938 189 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 NOTUMQ6P988 496 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PADI6Q6TGC4 694 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNT2Q6UVM3 1135 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CNNM3Q8NE01 707 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 URGCPQ8TCY9 931 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ASAP3Q8TDY4 903 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 LPPQ93052 612 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 TLR9Q9NR96 1032 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 RNF19AQ9NV58 838 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 HCSTQ9UBK5 93 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA1024Q9UPX6 916 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 GLRA2P23416 452 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC55Q6ZSA7 311 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 HACE1Q8IYU2 909 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 IGSF22Q8N9C0 903 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC51Q96ER9 411 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 SPG21Q9NZD8 308 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 DNM3Q9UQ16 869 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM50BQ9Y247 325 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 MYO7AQ13402 2215 aa17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-215ENST00000589825 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 TNFRSF10AO00220 468 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP11B2P19099 503 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJB1P25685 340 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM132AQ24JP5 1023 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 NOMO2Q5JPE7 1267 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 IFT74Q96LB3 600 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 NFKBIZQ9BYH8 718 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 C2orf40Q9H1Z8 148 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 UBN1Q9NPG3 1134 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 LZTS1Q9Y250 596 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa17.83■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPAN1O60635 241 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGA4P13612 1032 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 PLCB3Q01970 1234 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 MBTD1Q05BQ5 628 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-215ENST00000589825 HYAL1Q12794 435 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms