RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589424.5

USP36-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP36, Length 970 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-216ENST00000589424 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.11■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.11■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 SKIP12755 728 aa22.1■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 RAB27AP51159 221 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP36-216ENST00000589424 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP36-216ENST00000589424 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.09■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 POMKQ9H5K3 350 aa22.09■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.09■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.09■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.09■■□□□ 1.13
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USP36-216ENST00000589424 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.09■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.08■■□□□ 1.13
USP36-216ENST00000589424 ZNF623O75123 536 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP36-216ENST00000589424 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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USP36-216ENST00000589424 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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USP36-216ENST00000589424 CARNS1A5YM72 827 aa22.07■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 B4GALT3O60512 393 aa22.07■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 OFD1O75665 1012 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 GALTP07902 379 aa22.07■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 CTSAP10619 480 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 CEP170P1Q96L14 293 aa22.07■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 PHOX2BQ99453 314 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 STK36Q9NRP7 1315 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 SLC11A1P49279 550 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 OXER1Q8TDS5 423 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 HAS1Q92839 578 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 TMEM143Q96AN5 459 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 PGBD4Q96DM1 585 aa22.06■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 LXNQ9BS40 222 aa22.06■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 EPCAMP16422 314 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 MTHFRP42898 656 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP36-216ENST00000589424 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.05■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.05■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 PPME1Q9Y570 386 aa22.05■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 USP34Q70CQ2 3546 aa22.05■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.05■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 TBX3O15119 743 aa22.04■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.04■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.04■■□□□ 1.12
USP36-216ENST00000589424 PTPN14Q15678 1187 aa22.04■■□□□ 1.12
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