RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL13Q8N6R0 699 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHDC9Q8NEP7 349 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TSKSQ9UJT2 592 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 DRP2Q13474 957 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 KSR1Q8IVT5 923 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MYADML2A6NDP7 307 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PGK1P00558 417 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 GNAT1P11488 350 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 COPB1P53618 953 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC42EP1Q00587 391 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 STRN3Q13033 797 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH8Q5T0T0 291 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MKNK1Q9BUB5 465 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 KIFC3Q9BVG8 833 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKBIZQ9BYH8 718 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 K7ERI5 159 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 LMBR1Q8WVP7 490 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP7D2Q96T17 732 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCN3P51790 818 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NR1I3Q14994 352 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF180Q86T96 592 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SETD4Q9NVD3 440 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 DMAC2Q9NW81 257 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN22Q9Y2R2 807 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PCNTO95613 3336 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC8P31273 242 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM17P78536 824 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NFRKBQ6P4R8 1299 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RHPN2Q8IUC4 686 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 N4BP3O15049 544 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGRP01833 764 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC40Q4G0X9 1142 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD5Q7Z6J6 570 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CREBRFQ8IUR6 639 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF710Q8N1W2 664 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF149Q8NC42 400 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CLIC2O15247 247 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MAN2A1Q16706 1144 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS1R3Q7RTX0 852 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf31Q8N865 590 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF2KMTQ96G04 330 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CABYRO75952 493 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 EPB41P11171 864 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R3AQ06190 1150 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DRC7Q8IY82 874 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TAB2Q9NYJ8 693 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 AKT3Q9Y243 479 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf102A2RUQ5 167 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PTENP60484 403 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK13O15264 365 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ASGR1P07306 291 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 GARTP22102 1010 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PHKA2P46019 1235 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNA10Q16322 511 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMCX5Q6P1M9 558 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL17Q6UXB2 119 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF410Q86VK4 478 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC113Q9H0I3 377 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS16Q9H269 839 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS13Q9NVM9 706 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 IMPACTQ9P2X3 320 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS16A8MUM7 142 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP4BP1P59074 171 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK6Q16659 721 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ZPBP2Q6X784 338 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SESTD1Q86VW0 696 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 BICD1Q96G01 975 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC6Q9UBN7 1215 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
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