RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	MYCT1	Q8N699	235 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	DDX12P	Q92771	950 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	TNMD	Q9H2S6	317 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	TMX1	Q9H3N1	280 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		27.54	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	IDE	P14735	1019 aa		27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	GIT2	Q14161	759 aa		27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	SLC9A7	Q96T83	725 aa		27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ADAM2	Q99965	735 aa		27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MGEA5	O60502	916 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	UPP2	O95045	317 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	PLS3	P13797	630 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	AFM	P43652	599 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	NPTX2	P47972	431 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	SMTN	P53814	917 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	AMPD3	Q01432	767 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	POU5F1B	Q06416	359 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	PARVG	Q9HBI0	331 aa		27.52	■■■□□ 2
GPS1-223	ENST00000584229	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	SLC16A4	O15374	487 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	HPSE	Q9Y251	543 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229		K7ENM7	598 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	ENPP3	O14638	875 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PRKCB	P05771	671 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	MAPK6	Q16659	721 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CPB2	Q96IY4	423 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TTC3	P53804	2025 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	ASIC1	P78348	528 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	DACT1	Q9NYF0	836 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	USP25	Q9UHP3	1055 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229		K7ERI5	159 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN1	O60635	241 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	SLFN14	P0C7P3	912 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	EFNA5	P52803	228 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	LONRF3	Q496Y0	759 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	SFR1	Q86XK3	245 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	RNF169	Q8NCN4	708 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CNNM3	Q8NE01	707 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	RGS18	Q9NS28	235 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	B4GALT5	O43286	388 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TRAK2	O60296	914 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	RABGGTB	P53611	331 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	GBP4	Q96PP9	640 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CHST12	Q9NRB3	414 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	PANK4	Q9NVE7	773 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF202	O95125	648 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CASP1	P29466	404 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF131	P52739	623 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	STRN3	Q13033	797 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	DSC3	Q14574	896 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	NOTUM	Q6P988	496 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM9	Q9C026	710 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		27.46	■■□□□ 1.99

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