RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	SLC18A1	P54219	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ASIC1	P78348	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	RASSF7	Q02833	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	KLC1	Q07866	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	CUL3	Q13618	768 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	TAF11	Q15544	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ASIC2	Q16515	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	IL17A	Q16552	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	CABP7	Q86V35	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	DCC	P43146	1447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PFAS	O15067	1338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	COL18A1	P39060	1754 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BBS4-216	ENST00000569151	MYH6	P13533	1939 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	KRIT1	O00522	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	KCNK3	O14649	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	EPHB6	O15197	1021 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	NCK2	O43639	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TLR2	O60603	784 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	UBOX5	O94941	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	FTCD	O95954	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	IMPDH2	P12268	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RARG	P13631	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SMPD1	P17405	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PLCG1	P19174	1290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ITGA6	P23229	1130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CHRNA3	P32297	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MAGEA8	P43361	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	KLK7	P49862	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PMS2	P54278	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CABP4	P57796	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	OCRL	Q01968	901 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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