RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFRSF25Q93038 417 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM122AQ96E09 287 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM20AQ96MK3 541 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 POTEMA6NI47 508 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTBD18B2RXH4 712 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBX3O15119 743 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4GALT3O60512 393 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEMFO60524 1076 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 WEE2P0C1S8 567 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TXKP42681 527 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCAR1P56945 870 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLCB3Q01970 1234 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT17Q04695 432 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 COASYQ13057 564 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM29Q14134 588 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPHA7Q15375 998 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALCRLQ16602 461 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF149Q8NC42 400 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM169Q96HH4 297 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOL6Q9BWW8 343 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 LZTS1Q9Y250 596 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR33A8MZF0 331 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 USO1O60763 962 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERLIN2O94905 339 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 EYA4O95677 639 aa8□□□□□ -1.13
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RFC5P40937 340 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC11A1P49279 550 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB27AP51159 221 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAEAQ7L5Y9 396 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 FERMT3Q86UX7 667 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 C4orf19Q8IY42 314 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS52Q8N1B4 723 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASAP3Q8TDY4 903 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPB2Q96IY4 423 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTRQ99707 1265 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM60Q9H2L4 133 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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CCNDBP1-212ENST00000567690 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHST12Q9NRB3 414 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUC3AQ02505 3323 aa8□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 OFD1O75665 1012 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 POMCP01189 267 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYBP10242 640 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPCAMP16422 314 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC42EP1Q00587 391 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPSQ13938 189 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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