RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ZBTB33Q86T24 672 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 GJA10Q969M2 543 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 OSMRQ99650 979 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 ADAMTS10Q9H324 1103 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 CACNA1AO00555 2505 aa12.92□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 EFCAB12Q6NXP0 572 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 TMC7Q7Z402 723 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 SLFN12Q8IYM2 578 aa12.92□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 METTL13Q8N6R0 699 aa12.92□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 ZNF558Q96NG5 402 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 MAP7D2Q96T17 732 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 APOL5Q9BWW9 433 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 POMKQ9H5K3 350 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 SPG21Q9NZD8 308 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 CDH22Q9UJ99 828 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 PPME1Q9Y570 386 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 DNAH14Q0VDD8 3507 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 EML1O00423 815 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 JAK2O60674 1132 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 MAFO75444 373 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 SP100P23497 879 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 BTBD18B2RXH4 712 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 DTNBO60941 627 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 VTNP04004 478 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 PBX3P40426 434 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 MTHFRP42898 656 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 CLCN5P51795 746 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 TRIM29Q14134 588 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 EPHA7Q15375 998 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 CLLU1OSQ5K130 101 aa12.9□□□□□ -0.34
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CS-221ENST00000550734 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 ECHDC2Q86YB7 292 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 C4orf19Q8IY42 314 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 EXOC8Q8IYI6 725 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 USTQ9Y2C2 406 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-221ENST00000550734 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 A0A0U1RQF3 1178 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 FAM205CA6NFA0 338 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 EOMESO95936 686 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DARSP14868 501 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 GPC3P51654 580 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 KIAA1841Q6NSI8 718 aa12.89□□□□□ -0.35
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CS-221ENST00000550734 ABI1Q8IZP0 508 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 LRRC71Q8N4P6 559 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SMOC2Q9H3U7 446 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 AKT3Q9Y243 479 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 IRAK3Q9Y616 596 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 LYPLA2O95372 231 aa12.88□□□□□ -0.35
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CS-221ENST00000550734 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 MTERF2Q49AM1 385 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 RSPH1Q8WYR4 309 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 MTMR9Q96QG7 549 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12.88□□□□□ -0.35
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