RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.82■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.82■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.82■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.82■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.82■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.81■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 WDR81Q562E7 1941 aa22.81■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 EMC2Q15006 297 aa22.8■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.8■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.8■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.8■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.78■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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PRDM4-205ENST00000550376 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.78■■□□□ 1.24
PRDM4-205ENST00000550376 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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