RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 IL31Q6EBC2 164 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SESTD1Q86VW0 696 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SPATA24Q86W54 205 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PGBD3Q8N328 593 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CEP44Q9C0F1 390 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 VCXQ9H320 206 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ADAMTS4O75173 837 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 MBD3O95983 291 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 KRT7P08729 469 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ALOX5P09917 674 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SERPINB6P35237 376 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PFKPQ01813 784 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 KDSRQ06136 332 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 E2F2Q14209 437 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 C8orf74Q6P047 294 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SYNE4Q8N205 404 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ACAP3Q96P50 834 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 MXD3Q9BW11 206 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 JCADQ9P266 1359 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 A0A1B0GVG6 124 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ANO9A1A5B4 782 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 HDAC3O15379 428 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NCAM2O15394 837 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 HLA-DRAP01903 254 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 HLFQ16534 295 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 FAM209AQ5JX71 171 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 RAPGEF5Q92565 580 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CDCA5Q96FF9 252 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 HACD3Q9P035 362 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 BCL9O00512 1426 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 K7ENM7 598 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SGK1O00141 431 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 GSTT2P0CG29 244 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 GSTT2BP0CG30 244 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CALM1P0DP23 149 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CALM2P0DP24 149 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CALM3P0DP25 149 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NEK3P51956 506 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CHMP4BP1P59074 171 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CSNK2BP67870 215 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TFCP2Q12800 502 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NR1D2Q14995 579 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SMIM5Q71RC9 77 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CNTROBQ8N137 903 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 IRGQQ8WZA9 623 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 HAUS1Q96CS2 278 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TPK1Q9H3S4 243 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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