RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 CAPSQ13938 189 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 CAMK1Q14012 370 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 NACC1Q96RE7 527 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 CLDND1Q9NY35 253 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.6■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 FGF18O76093 207 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 SKIP12755 728 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 RPA1P27694 616 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 IRS1P35568 1242 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 HYAL1Q12794 435 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF558Q96NG5 402 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 TRAIPQ9BWF2 469 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 IGFLR1Q9H665 355 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 TTC28Q96AY4 2481 aa15.59■□□□□ 0.09
BRMS1-209ENST00000534617 MYO7AQ13402 2215 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TNFRSF10AO00220 468 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GLRA2P23416 452 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ARL2P36404 184 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PTENP60484 403 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 UBE3AQ05086 875 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 RAB34Q9BZG1 259 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TLR9Q9NR96 1032 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.58■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 LAD1O00515 517 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TSPAN1O60635 241 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 24.4
BRMS1-209ENST00000534617 PPM1AP35813 382 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PGBD4Q96DM1 585 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 CPB2Q96IY4 423 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 BACH2Q9BYV9 841 aa15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PP2D1A8MPX8 630 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 LINC01565O15544 149 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NCK2O43639 380 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF623O75123 536 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MUTP22033 750 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NRIP1P48552 1158 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 COL19A1Q14993 1142 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ECM1Q16610 540 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 UBXN11Q5T124 520 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NOTUMQ6P988 496 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PADI6Q6TGC4 694 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GBP3Q9H0R5 595 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SPG21Q9NZD8 308 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.56■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TBX10O75333 385 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 IL9P15248 144 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 AXLP30530 894 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PRPHP41219 470 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NDUFV1P49821 464 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 BCAR1P56945 870 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 POU5F1BQ06416 359 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PDIA5Q14554 519 aa15.55■□□□□ 0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms