RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF503	Q96F45	646 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	LRGUK	Q96M69	825 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	OXSM	Q9NWU1	459 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	DSE	Q9UL01	958 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM50B	Q9Y247	325 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702		K7ESF4	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNK3	O14649	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM27	P14373	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT15	P19012	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	IRF9	Q00978	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC23A	Q15436	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	DLG3	Q92796	817 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF202	O95125	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	KNG1	P01042	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	COMT	P21964	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	MCM7	P33993	719 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	GLRB	P48167	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	OCRL	Q01968	901 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	GRIN1	Q05586	938 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	EDA	Q92838	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SARG	Q9BW04	601 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702		H7C1D1	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC27A2	O14975	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	LTF	P02788	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CD53	P19397	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CSF2RB	P32927	897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	INHBE	P58166	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	PHC1	P78364	1004 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	MORC3	Q14149	939 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	EXTL1	Q92935	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM49B-222	ENST00000522702		H0Y858	1186 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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