RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC23A3Q6PIS1 610 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TREML4Q6UXN2 200 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 AGMOQ6ZNB7 445 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 EEPD1Q7L9B9 569 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO33Q7Z6M2 555 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 BIVMQ86UB2 503 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 HEATR4Q86WZ0 1026 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYT12Q8IV01 421 aa2.35□□□□□ -2.03
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GALNT11Q8NCW6 608 aa2.34□□□□□ -2.03
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TCTN2Q96GX1 697 aa2.34□□□□□ -2.03
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC6Q99741 560 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 KATNAL1Q9BW62 490 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLA2G12BQ9BX93 195 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHMP4AQ9BY43 222 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 VTA1Q9NP79 307 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXD4L1Q9NU39 408 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 BABAM1Q9NWV8 329 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO40Q9UH90 709 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC6A14Q9UN76 642 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC8A2Q9UPR5 921 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYH13Q9UKX3 1938 aa2.34□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
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