RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 MTMR9Q96QG7 549 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DNAJC7Q99615 494 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ASB7Q9H672 318 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 Q9Y3F1 56 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GPC3P51654 580 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 UBXN2AP68543 259 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RBP5P82980 135 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 USP38Q8NB14 1042 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 C3orf20Q8ND61 904 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SNX25Q9H3E2 840 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 JAG2Q9Y219 1238 aa6.29□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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POLK-215ENST00000514141 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PRCPP42785 496 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 LMAN1P49257 510 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RWDD2BP57060 319 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CREMQ03060 361 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DGKDQ16760 1214 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SFR1Q86XK3 245 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 KIF28PB7ZC32 967 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TJP3O95049 919 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CA4P22748 312 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CENPCQ03188 943 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SNX17Q15036 470 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SLC18A3Q16572 532 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CDKL2Q92772 493 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DYDC2Q96IM9 177 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DPP7Q9UHL4 492 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 H0YHG0 523 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CASP14P31944 242 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MCL1Q07820 350 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 BFSP1Q12934 665 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PKP1Q13835 747 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EPSTI1Q96J88 318 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 UROC1Q96N76 676 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 EVI5O60447 810 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 EFCAB14O75071 495 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 PCSK2P16519 638 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 RASSF2P50749 326 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 CYP2J2P51589 502 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 KCNH2Q12809 1159 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 SMARCB1Q12824 385 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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POLK-215ENST00000514141 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 CCNJLQ8IV13 435 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 TMX1Q9H3N1 280 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 CYLDQ9NQC7 956 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 PXMP2Q9NR77 195 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 HACD3Q9P035 362 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.27□□□□□ -1.41
POLK-215ENST00000514141 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.27□□□□□ -1.41
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