RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 FOXN1O15353 648 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ONECUT2O95948 504 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 C21orf58P58505 322 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 TM4SF20Q53R12 229 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 FIGNQ5HY92 759 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 FUKQ8N0W3 1084 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SCLYQ96I15 445 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 BTBD7Q9P203 1132 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 PTCH1Q13635 1447 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 RALGAPBQ86X10 1494 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRB2O60241 1585 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 GLI3P10071 1580 aa4.09□□□□□ -1.75
ATXN3-211ENST00000511362 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 SCDO00767 359 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 GSTA4O15217 222 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 TET3O43151 1660 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CEP152O94986 1710 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 PTGS1P23219 599 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 POLD1P28340 1107 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ADCY8P40145 1251 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 RRADP55042 308 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 IL13RA1P78552 427 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 INCENPQ9NQS7 918 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 GALNT8Q9NY28 637 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.08□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 FMN1Q68DA7 1419 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 PROB1E7EW31 1015 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CLSTN1O94985 981 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 MPIG6BO95866 241 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 NUDT3O95989 172 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 MMEP08473 750 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 NAT1P18440 290 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 AOAHP28039 575 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 GJA4P35212 333 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 KCNQ1P51787 676 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 PRELPP51888 382 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 RNF151Q2KHN1 245 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 LILRB2Q8N423 598 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ARMC5Q96C12 935 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 AMNQ9BXJ7 453 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 SPON1Q9HCB6 807 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.07□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 DCCP43146 1447 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 RASSF10A6NK89 507 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 EFCAB14O75071 495 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ACRV1P26436 265 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ECE1P42892 770 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 HERVK_113P62684 666 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 CD83Q01151 205 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 FSTL1Q12841 308 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 TBR1Q16650 682 aa4.06□□□□□ -1.76
ATXN3-211ENST00000511362 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms