RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 A0A0G2JLW4 131 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 GPR42O15529 346 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 COL6A1P12109 1028 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DPEP1P16444 411 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 KCNJ6P48051 423 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PPP2R2AP63151 447 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 KRT24Q2M2I5 525 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PARP10Q53GL7 1025 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 EMC4Q5J8M3 183 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PHF19Q5T6S3 580 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TEPPQ6URK8 271 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SPRED1Q7Z699 444 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PROSER1Q86XN7 944 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.57e-14■■□□□ 11.4
RBM39-240ENST00000495293 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CD248Q9HCU0 757 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PQU0 124 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 MSCO60682 206 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 ANXA1P04083 346 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 GPTP24298 496 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 YY1P25490 414 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 KCNAB2Q13303 367 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 RAB33AQ14088 237 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 HLFQ16534 295 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 STEAP3Q658P3 488 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 IQCEQ6IPM2 695 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PRR5LQ6MZQ0 368 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 SCN7AQ01118 1682 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 BCORQ6W2J9 1755 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 LAMTOR5O43504 91 aa5.63□□□□□ -1.51
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RBM39-240ENST00000495293 LTBRP36941 435 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 NKX3-2P78367 333 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 LSAMPQ13449 338 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 TCIRG1Q13488 830 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PROSER3Q2NL68 480 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 DPH6Q7L8W6 267 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 MASTLQ96GX5 879 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 ZNF536O15090 1300 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 NUP98P52948 1817 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 C9orf118A6NHY6 69 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 H7BY64 318 aa5.62□□□□□ -1.51
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RBM39-240ENST00000495293 STYK1Q6J9G0 422 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 BORAQ6PGQ7 559 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 KSR2Q6VAB6 950 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 SPATC1Q76KD6 591 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 TSPYL6Q8N831 410 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 DNERQ8NFT8 737 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-240ENST00000495293 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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