RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 SPATA1Q5VX52 437 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CABP7Q86V35 215 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 VSTM4Q8IW00 320 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PDILTQ8N807 584 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 LRRC15Q8TF66 581 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 LPAR1Q92633 364 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 HAS1Q92839 578 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 RAB34Q9BZG1 259 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM260Q9NX78 707 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 FEM1BQ9UK73 627 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PNMA2Q9UL42 364 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 MYH6P13533 1939 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM232C9JQI7 657 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TDP2O95551 362 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PTGS1P23219 599 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PBX1P40424 430 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 AMPD3Q01432 767 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PCDH1Q08174 1060 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 GRB10Q13322 594 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 RASA3Q14644 834 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 UBE2SQ16763 222 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ADSSL1Q8N142 457 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ACER1Q8TDN7 264 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 LENG9Q96B70 501 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 HOOK2Q96ED9 719 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 FAM20AQ96MK3 541 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 WDR18Q9BV38 432 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ANO3Q9BYT9 981 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TRIM9Q9C026 710 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF576Q9H609 170 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 INTS13Q9NVM9 706 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 FANCLQ9NW38 375 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 IFNKQ9P0W0 207 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ABCB11O95342 1321 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PP2D1A8MPX8 630 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 F8W735 103 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ATP1A3P13637 1013 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PLCG1P19174 1290 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 MUTP22033 750 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ITPKAP23677 461 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF76P36508 570 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ECE1P42892 770 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 AFMP43652 599 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CCZ1BP86790 482 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 SPAG1Q07617 926 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 FAAP100Q0VG06 881 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 NR1I3Q14994 352 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ACAD11Q709F0 780 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ATG4A-208ENST00000489247 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms