RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TMED2Q15363 201 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 EFHC2Q5JST6 749 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KRT7P08729 469 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PDGFRBP09619 1106 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ADORA1P30542 326 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SEPT2Q15019 361 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KIZQ2M2Z5 673 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 FANCBQ8NB91 859 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TSPOAP1O95153 1857 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CYP27B1O15528 508 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ORC4O43929 436 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CDK17Q00537 523 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 8.5
TTC3-215ENST00000476784 SGO2Q562F6 1265 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TEX9Q8N6V9 391 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ABCC4O15439 1325 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ZNF202O95125 648 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CDK8P49336 464 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 MORC3Q14149 939 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 RAPGEF5Q92565 580 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ZNF560Q96MR9 790 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CUEDC2Q9H467 287 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KCNJ18B7U540 433 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KCNQ3O43525 872 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 GFPT2O94808 682 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 AMHP03971 560 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KCNJ12Q14500 433 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 DDIASQ8IXT1 998 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 USP33Q8TEY7 942 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 RABGGTAQ92696 567 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 GALNT8Q9NY28 637 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PKP3Q9Y446 797 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TEX28O15482 410 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 FYNP06241 537 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 LMNB2Q03252 620 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PWP1Q13610 501 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PCSK7Q16549 785 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KRT77Q7Z794 578 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 GBP5Q96PP8 586 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CHST12Q9NRB3 414 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 KLHL3Q9UH77 587 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SLC9A1P19634 815 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PSMA3P25788 255 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CHRNA3P32297 505 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 RASSF2P50749 326 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PTH1RQ03431 593 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 GRIN1Q05586 938 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TP53BP2Q13625 1128 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 MUM1Q2TAK8 710 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 BBS9Q3SYG4 887 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 RNF149Q8NC42 400 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 A0A087X0T9 212 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 DPEP1P16444 411 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 MXI1P50539 228 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-215ENST00000476784 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms