RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474144.5

TMEM54-204, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM54, Length 748 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-204ENST00000474144 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 OR52Z1P0C646 297 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 NRIP1P48552 1158 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 UBE3AQ05086 875 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 ADAM15Q13444 863 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 TLR9Q9NR96 1032 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 PER2O15055 1255 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 ASAP2O43150 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 PLCB3Q01970 1234 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 ZNF558Q96NG5 402 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM54-204ENST00000474144 FSCN2O14926 492 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ST18O60284 1047 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 DGAT1O75907 488 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ARL2P36404 184 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 CAPSQ13938 189 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 UBXN11Q5T124 520 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TMX3Q96JJ7 454 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ZNF623O75123 536 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 OFD1O75665 1012 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 SKIP12755 728 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 GLRA2P23416 452 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PTENP60484 403 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 EFHBQ8N7U6 833 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 CLEC1BQ9P126 229 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 C5orf42Q9H799 3197 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TSPAN1O60635 241 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 GLP2RO95838 553 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 NDUFV1P49821 464 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 RAB27AP51159 221 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 BCAR1P56945 870 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 POTEGQ6S5H5 508 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 CPB2Q96IY4 423 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TLE6Q9H808 572 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 SPG21Q9NZD8 308 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 LZTS1Q9Y250 596 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 MBTPS2O43462 519 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TRAPPC10P48553 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TFDP1Q14186 410 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ECM1Q16610 540 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TCF25Q9BQ70 676 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 HIDE1A8MVS5 230 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 B4GALT3O60512 393 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 ERLIN2O94905 339 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 RPA1P27694 616 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PPM1AP35813 382 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 KRT17Q04695 432 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 AMHR2Q16671 573 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 DUSP6Q16828 381 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 GJD3Q8N144 294 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-204ENST00000474144 PGBD4Q96DM1 585 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms