RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CLTAP09496 248 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SHMT1P34896 483 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 IFNAR2P48551 515 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CYP4A11Q02928 519 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CRYMQ14894 314 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CNGA2Q16280 664 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 Q4G0T1 1027 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CFAP73A6NFT4 308 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 FAM86B1E9PN63 330 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TBX3O15119 743 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 GNPATO15228 680 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ALAS1P13196 640 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SLCO1A2P46721 670 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 COG2Q14746 738 aa11.17□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SNX3O60493 162 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TNFAIP3P21580 790 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 NFIL3Q16649 462 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 BARGINQ6ZT62 677 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 VAV3Q9UKW4 847 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 PODXLO00592 558 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 UBOX5O94941 541 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RARAP10276 462 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 AP3B2Q13367 1082 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 KIF22Q14807 665 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC38Q502W7 563 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CROCCP2Q86T23 111 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.16□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RASGRF2O14827 1237 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 EYA4O95677 639 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TRIM49P0CI25 452 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TRIM49CP0CI26 452 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RARGP13631 454 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ALADP13716 330 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 HSPA6P17066 643 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 GBP1P32455 592 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 NCALDP61601 193 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 KCNJ2P63252 427 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 MFSD5Q6N075 450 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 KSR1Q8IVT5 923 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 HOOK2Q96ED9 719 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 PARP2Q9UGN5 583 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 MSH4O15457 936 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 GAP43P17677 238 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 PEX5P50542 639 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 GALNTL6Q49A17 601 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 ART4Q93070 314 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 GGT7Q9UJ14 662 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SIPA1L1O43166 1804 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 SMCHD1A6NHR9 2005 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
LINC00886-201ENST00000472943 EML1O00423 815 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms