RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 GPM6BQ13491 265 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 HYIQ5T013 277 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ABI1Q8IZP0 508 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.06■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 KCNK18Q7Z418 384 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CABP7Q86V35 215 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PNMA5Q96PV4 448 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PLVAPQ9BX97 442 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 RNF19AQ9NV58 838 aa22.05■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 SLC26A4O43511 780 aa22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 UBA7P41226 1012 aa22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 RAB27AP51159 221 aa22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PTPAQ15257 358 aa22.04■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 TSPAN1O60635 241 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF623O75123 536 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 AXLP30530 894 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 GRIN1Q05586 938 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PPP2R5AQ15172 486 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PTPROQ16827 1216 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 BSNDQ8WZ55 320 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 KIFAP3Q92845 792 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CASD1Q96PB1 797 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PLIN2Q99541 437 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.03■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 NAMPTP43490 491 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 AMHR2Q16671 573 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 NOTUMQ6P988 496 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 P2RX5Q93086 422 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC51Q96ER9 411 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 CALML4Q96GE6 196 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 IFT74Q96LB3 600 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 POLD4Q9HCU8 107 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 AAASQ9NRG9 546 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.02■■□□□ 1.12
CTPS1-206ENST00000470271 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 UBXN11Q5T124 520 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC43Q8N309 656 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 DEPTORQ8TB45 409 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 HELQQ8TDG4 1101 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 LPPQ93052 612 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PGBD4Q96DM1 585 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 USP28Q96RU2 1077 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 LONRF3Q496Y0 759 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 RSPH1Q8WYR4 309 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 CPB2Q96IY4 423 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 CWH43Q9H720 699 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 HCSTQ9UBK5 93 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 XIRP2A4UGR9 3374 aa22■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 GRM6O15303 877 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 B4GALT5O43286 388 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 HIP1RO75146 1068 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G4BP0C869 781 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 LAG3P18627 525 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 SLC12A3P55017 1021 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 CNNM3Q8NE01 707 aa21.99■■□□□ 1.11
CTPS1-206ENST00000470271 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.99■■□□□ 1.11
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