RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 USP38Q8NB14 1042 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 NACC1Q96RE7 527 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 STXBP3O00186 592 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTS4O75173 837 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ARP10275 920 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ELF1P32519 619 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 POSTNQ15063 836 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 E2F4Q16254 413 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KANK3Q6NY19 840 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SARM1Q6SZW1 724 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BANK1Q8NDB2 785 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IL31RAQ8NI17 732 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SHISA4Q96DD7 197 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MYH1P12882 1939 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BTBD18B2RXH4 712 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MYO1CO00159 1063 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ENC1O14682 589 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA0355O15063 1070 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TREHO43280 583 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MCM3P25205 808 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KRT9P35527 623 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TECP42680 631 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFV1P49821 464 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LIG3P49916 1009 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PRKCEQ02156 737 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 NME8Q8N427 588 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IFT81Q8WYA0 676 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 POLIQ9UNA4 740 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ESYT2A0FGR8 921 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PITPNM1O00562 1244 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CYTH3O43739 400 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 AKR1B10O60218 316 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CMA1P23946 247 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SREBF1P36956 1147 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP1Q07960 439 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FAAP100Q0VG06 881 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 USP37Q86T82 979 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KCNB2Q92953 911 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RAD9AQ99638 391 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 OR52Z1P0C646 297 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 AMPD3Q01432 767 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 Q7L0L9 218 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CEP57Q86XR8 500 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LRCH3Q96II8 777 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CEP89Q96ST8 783 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 OSMRQ99650 979 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ADAM2Q99965 735 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 COL20A1Q9P218 1284 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CEP350Q5VT06 3117 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PIK3CDO00329 1044 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BAIAP3O94812 1187 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 OATP04181 439 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IQCF3P0C7M6 154 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ACTN2P35609 894 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CLCN3P51790 818 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RABGGTBP53611 331 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SESTD1Q86VW0 696 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SLC35F6Q8N357 371 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms