RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	RNF169	Q8NCN4	708 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	KIFAP3	Q92845	792 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	EPSTI1	Q96J88	318 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	HIP1R	O75146	1068 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	PLA2G4B	P0C869	781 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	PLCG1	P19174	1290 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	IGFBP4	P22692	258 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	PPP2R5A	Q15172	486 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	USP49	Q70CQ1	688 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	IFT74	Q96LB3	600 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PNCK-222	ENST00000466638	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	SPTLC2	O15270	562 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	TSPAN1	O60635	241 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	FGFR1	P11362	822 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	NAMPT	P43490	491 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	SLC12A3	P55017	1021 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	ADGRE1	Q14246	886 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM192	Q8IY95	271 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CPB2	Q96IY4	423 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DRC1	Q96MC2	740 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	SAMD11	Q96NU1	681 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DLL1	O00548	723 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	HOXA2	O43364	376 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	YEATS4	O95619	227 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	BRD1	O95696	1058 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	EOMES	O95936	686 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	SKI	P12755	728 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	GUCY2C	P25092	1073 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	AXL	P30530	894 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CTNNB1	P35222	781 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	TXLNA	P40222	546 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	RAB27A	P51159	221 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	EPC2	Q52LR7	807 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	NOTUM	Q6P988	496 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	LRRC15	Q8TF66	581 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	B4GALT5	O43286	388 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	PPP6R2	O75170	966 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	LINC00271	P0C7V0	271 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	MAPK7	Q13164	816 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	AMHR2	Q16671	573 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	ABI1	Q8IZP0	508 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	DAW1	Q8N136	415 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	RAD54L	Q92698	747 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	RNF19A	Q9NV58	838 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	KCND2	Q9NZV8	630 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CCDC169	A6NNP5	214 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	LPXN	O60711	386 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	LIG1	P18858	919 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	BMPR1A	P36894	532 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	PEX3	P56589	373 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	MCM6	Q14566	821 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	LONRF3	Q496Y0	759 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	ATL3	Q6DD88	541 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	GPBP1	Q86WP2	473 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PNCK-222	ENST00000466638	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51

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