RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 RAB27AP51159 221 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 GPM6BQ13491 265 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 PTPAQ15257 358 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 CABP7Q86V35 215 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 ABI1Q8IZP0 508 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 RNF19AQ9NV58 838 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 TSPAN1O60635 241 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 RB1P06400 928 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 GRIN1Q05586 938 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 BSNDQ8WZ55 320 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 PLIN2Q99541 437 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.97■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 SLC26A4O43511 780 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 AXLP30530 894 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 UBA7P41226 1012 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 PPP2R5AQ15172 486 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 KIFAP3Q92845 792 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 CASD1Q96PB1 797 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 PLVAPQ9BX97 442 aa22.96■■□□□ 1.27
VARS-218ENST00000459667 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 NAMPTP43490 491 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 BECN1Q14457 450 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 AMHR2Q16671 573 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PTPROQ16827 1216 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 NOTUMQ6P988 496 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 HELQQ8TDG4 1101 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CALML4Q96GE6 196 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 IFT74Q96LB3 600 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 USP28Q96RU2 1077 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 POLD4Q9HCU8 107 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 HCSTQ9UBK5 93 aa22.95■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ZNF623O75123 536 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
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VARS-218ENST00000459667 UBXN11Q5T124 520 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 LRRC43Q8N309 656 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 DEPTORQ8TB45 409 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 LPPQ93052 612 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 P2RX5Q93086 422 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CCDC51Q96ER9 411 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CPB2Q96IY4 423 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 EYSQ5T1H1 3165 aa22.94■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 B4GALT5O43286 388 aa22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PGBD4Q96DM1 585 aa22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CSRNP2Q9H175 543 aa22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CWH43Q9H720 699 aa22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 AAASQ9NRG9 546 aa22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 GRM6O15303 877 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 HIP1RO75146 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PLA2G4BP0C869 781 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 LAG3P18627 525 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 GUCY2CP25092 1073 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SLC12A3P55017 1021 aa22.91■■□□□ 1.26
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