RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 DYDC2Q96IM9 177 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM20AQ96MK3 541 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 RGL1Q9NZL6 768 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ARID2Q68CP9 1835 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R2N6 131 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FSCN2O14926 492 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB39O15060 712 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 STBD1O95210 358 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 AK2P54819 239 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP2R5CQ13362 524 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 EPHA7Q15375 998 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TCP11Q8WWU5 503 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CASP10Q92851 521 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MBOAT7Q96N66 472 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 LXNQ9BS40 222 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf42Q9H799 3197 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A087WWV3 80 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM205CA6NFA0 338 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM221A6NGB7 291 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R296 226 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ERLIN2O94905 339 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ALDH2P05091 517 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 WEE2P0C1S8 567 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 RFC5P40937 340 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TXKP42681 527 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB27AP51159 221 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NEK4P51957 841 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZXDAP98168 799 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NR5A1Q13285 461 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 EMC2Q15006 297 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NPY5RQ15761 445 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CALCRLQ16602 461 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF149Q8NC42 400 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MTRQ99707 1265 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 APOL6Q9BWW8 343 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 CDH22Q9UJ99 828 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 VAV3Q9UKW4 847 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 NR2E1Q9Y466 385 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 PIEZO1Q92508 2521 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 STK36Q9NRP7 1315 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 C2CD2LO14523 706 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TBX3O15119 743 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ASAP2O43150 1006 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 OFD1O75665 1012 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 POMCP01189 267 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 GALTP07902 379 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 MYBP10242 640 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 ITGA4P13612 1032 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 KLRC2P26717 231 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 GUCY1B3Q02153 619 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-204ENST00000459646 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms