RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448828.5

NME4-206, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,167 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-206ENST00000448828 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 TTC28Q96AY4 2481 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 GRXCR2A6NFK2 248 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 ASAP2O43150 1006 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 TBX10O75333 385 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 DGAT1O75907 488 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 LYPLA2O95372 231 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 PPM1AP35813 382 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 TFDP1Q14186 410 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 COL19A1Q14993 1142 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 ERMNQ8TAM6 284 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 CA8P35219 290 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 RARRES1P49788 294 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 KRT17Q04695 432 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 TLE6Q9H808 572 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 KIF3AQ9Y496 699 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-206ENST00000448828 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 LTBRP36941 435 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 NBR1Q14596 966 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 PGBD4Q96DM1 585 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TCF25Q9BQ70 676 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 SPG21Q9NZD8 308 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 MYO7AQ13402 2215 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 PER2O15055 1255 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ERVFC1P60507 584 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 GBP3Q9H0R5 595 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 CD207Q9UJ71 328 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 MED24O75448 989 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 PLCB3Q01970 1234 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ADAM15Q13444 863 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 CAPSQ13938 189 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 MCTP1Q6DN14 999 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 POTEGQ6S5H5 508 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 EFHBQ8N7U6 833 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 LZTS1Q9Y250 596 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TRAPPC10P48553 1259 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 BCAR1P56945 870 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TMC7Q7Z402 723 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 GJD3Q8N144 294 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 URGCPQ8TCY9 931 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 PTENP60484 403 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TMEM169Q96HH4 297 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 CPB2Q96IY4 423 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TMX3Q96JJ7 454 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 NACC1Q96RE7 527 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 RSAD1Q9HA92 442 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 CD320Q9NPF0 282 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TBC1D13Q9NVG8 400 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 MBTPS2O43462 519 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 TSPAN1O60635 241 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 ZNF623O75123 536 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 GLRA2P23416 452 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 NOTUMQ6P988 496 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-206ENST00000448828 FSCN2O14926 492 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 OFD1O75665 1012 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 GLP2RO95838 553 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 RPA1P27694 616 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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