RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SFNP31947 248 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 DNM2P50570 870 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 CLCN3P51790 818 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 BECN1Q14457 450 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 INF2Q27J81 1249 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 GALNT17Q6IS24 598 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 LRRC55Q6ZSA7 311 aa13.09□□□□□ -0.31
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PRAME-210ENST00000442481 NLRP7Q8WX94 980 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.09□□□□□ -0.31
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PRAME-210ENST00000442481 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.09□□□□□ -0.31
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PRAME-210ENST00000442481 BRD1O95696 1058 aa13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 HELQQ8TDG4 1101 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 OXER1Q8TDS5 423 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 CYP26B1Q9NR63 512 aa13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 PRR23AA6NEV1 266 aa13.07□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.325e-69■□□□□ 8.2
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PRAME-210ENST00000442481 BCAR1P56945 870 aa13.07□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 CTSAP10619 480 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 CIITAP33076 1130 aa13.06□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 MCM2P49736 904 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 USP11P51784 963 aa13.06□□□□□ -0.32
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PRAME-210ENST00000442481 URGCPQ8TCY9 931 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 GJA10Q969M2 543 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 PGBD4Q96DM1 585 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 RIT2Q99578 217 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 ZBP1Q9H171 429 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 RNF19AQ9NV58 838 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 MYO10Q9HD67 2058 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 M0R2N6 131 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 MSH4O15457 936 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 MARCH6O60337 910 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 RFX1P22670 979 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 PHKA2P46019 1235 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 NEK8Q86SG6 692 aa13.05□□□□□ -0.32
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