RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439929.1

RPS29P3-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P3, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P3-201ENST00000439929 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.94□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.94□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RNF19AQ9NV58 838 aa9.94□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SQORQ9Y6N5 450 aa9.94□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 A0A1B0GVL5 298 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 EPOPA6NHQ4 379 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GJB5O95377 273 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NPTX2P47972 431 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 PEX3P56589 373 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GIT2Q14161 759 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 DYMQ7RTS9 669 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 USP38Q8NB14 1042 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 LPPQ93052 612 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 TOP1MTQ969P6 601 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 DHX58Q96C10 678 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CERS4Q9HA82 394 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RGS18Q9NS28 235 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 STK24Q9Y6E0 443 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CITO14578 2027 aa9.93□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 DENND3A2RUS2 1198 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GPR182O15218 404 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 AMHP03971 560 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 LINC00271P0C7V0 271 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 FGFR1P11362 822 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 PFKFB1P16118 471 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 LIG1P18858 919 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GUCY2CP25092 1073 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 STAT6P42226 847 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 PHKA2P46019 1235 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NUCB2P80303 420 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ATL3Q6DD88 541 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 HPS3Q969F9 1004 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 FIZ1Q96SL8 496 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CFAP45Q9UL16 551 aa9.92□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 LINC01553A4QN01 128 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC169A6NNP5 214 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RFXAPO00287 272 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SLC16A4O15374 487 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ASAP2O43150 1006 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SLC26A4O43511 780 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 TLL1O43897 1013 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 B4GALT3O60512 393 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NAMPTP43490 491 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NDUFA8P51970 172 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 TAP1Q03518 808 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 TFDP1Q14186 410 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RNF169Q8NCN4 708 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 KIFAP3Q92845 792 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 TIFAQ96CG3 184 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 RNF39Q9H2S5 420 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 FZD8Q9H461 694 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 STK17AQ9UEE5 414 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 HPSEQ9Y251 543 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS29P3-201ENST00000439929 HES2Q9Y543 173 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms