RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439504.6

ATG16L2-203, Transcript of autophagy related 16 like 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG16L2, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2-203ENST00000439504 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 HACL1Q9UJ83 578 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 NUP98P52948 1817 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MYO1FO00160 1098 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PDXKO00764 312 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 IVLP07476 585 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 FGFR4P22455 802 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CETN2P41208 172 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SLC12A3P55017 1021 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MDM1Q8TC05 714 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PGK2P07205 417 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ITGB5P18084 799 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SOX5P35711 763 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SREBF1P36956 1147 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MOB2Q70IA6 237 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CREG2Q8IUH2 290 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 GGA3Q9NZ52 723 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ALS2Q96Q42 1657 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TRIM50Q86XT4 487 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 GDAP1Q8TB36 358 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 KIFAP3Q92845 792 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SLIT2O94813 1529 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 M0R2N6 131 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PIAS1O75925 651 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CYP2C19P33261 490 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 NUMBP49757 651 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CDO1Q16878 200 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 BAP1Q92560 729 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TATDN2Q93075 761 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SLC35C1Q96A29 364 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CSADQ9Y600 493 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TUBBP07437 444 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 LMNB1P20700 586 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CNTN2Q02246 1040 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 EPHA7Q15375 998 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RNF169Q8NCN4 708 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CABS1Q96KC9 395 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 NUP85Q9BW27 656 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RIPK3Q9Y572 518 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CLDN3O15551 220 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 BFSP1Q12934 665 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 DR1Q01658 176 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 DENND2CQ68D51 928 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 USP37Q86T82 979 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 FAM160B2Q86V87 743 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 WNK4Q96J92 1243 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MED4Q9NPJ6 270 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 FEM1BQ9UK73 627 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 PCNTO95613 3336 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 WDR91A4D1P6 747 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TKFCQ3LXA3 575 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 GNPTABQ3T906 1256 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SGO2Q562F6 1265 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms