RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 ZNF623O75123 536 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 ZXDAP98168 799 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 GLB1LQ6UWU2 654 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 TMEM169Q96HH4 297 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 APOL5Q9BWW9 433 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 PIEZO1Q92508 2521 aa29.59■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 RAB27AP51159 221 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 EPHA7Q15375 998 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 C4orf19Q8IY42 314 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 EXOC8Q8IYI6 725 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 CASP10Q92851 521 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 FBXL18Q96ME1 805 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 TBC1D13Q9NVG8 400 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
UPP1-208ENST00000436673 TMEM221A6NGB7 291 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 M0R296 226 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 OFD1O75665 1012 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 RFC5P40937 340 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 POTEDQ86YR6 584 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 TMEM143Q96AN5 459 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 LXNQ9BS40 222 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 RGL1Q9NZL6 768 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CARNS1A5YM72 827 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CXCL14O95715 111 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ANAPC15P60006 121 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 SPIRE1Q08AE8 756 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 VPS52Q8N1B4 723 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ZBP1Q9H171 429 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa29.56■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 MARCH6O60337 910 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 GALTP07902 379 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 YWHABP31946 246 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 AK2P54819 239 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ANKRD1Q15327 319 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 WASF1Q92558 559 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 PGBD4Q96DM1 585 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 IGSF21Q96ID5 467 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 MINDY3Q9H8M7 445 aa29.55■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 FAM205CA6NFA0 338 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 FDPSP14324 419 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 NR5A1Q13285 461 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 OTUD6AQ7L8S5 288 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 TNFRSF25Q93038 417 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 DYDC2Q96IM9 177 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 GAS2O43903 313 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CA8P35219 290 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 NHLH1Q02575 133 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ADAM7Q9H2U9 754 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CDH22Q9UJ99 828 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 IRAK3Q9Y616 596 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 BAG4O95429 457 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CTSAP10619 480 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 KRT2P35908 639 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CYP4A11Q02928 519 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ITIH3Q06033 890 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 EMC2Q15006 297 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 NECAB1Q8N987 351 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 TCP11Q8WWU5 503 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 AUTS2Q8WXX7 1259 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-208ENST00000436673 ZBTB39O15060 712 aa29.51■■■□□ 2.31
UPP1-208ENST00000436673 ASAP2O43150 1006 aa29.51■■■□□ 2.31
UPP1-208ENST00000436673 B4GALT3O60512 393 aa29.51■■■□□ 2.31
UPP1-208ENST00000436673 SLC11A1P49279 550 aa29.51■■■□□ 2.31
UPP1-208ENST00000436673 SIGLEC14Q08ET2 396 aa29.51■■■□□ 2.31
UPP1-208ENST00000436673 PTPN21Q16825 1174 aa29.51■■■□□ 2.31
UPP1-208ENST00000436673 XKR9Q5GH70 373 aa29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms