RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CASD1Q96PB1 797 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF19AQ9NV58 838 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ERLIN2O94905 339 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 UBA7P41226 1012 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PLVAPQ9BX97 442 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO9BQ13459 2157 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF623O75123 536 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 AXLP30530 894 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ABI1Q8IZP0 508 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 BSNDQ8WZ55 320 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KIFAP3Q92845 792 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC26A4O43511 780 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPAN1O60635 241 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB27AP51159 221 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 AMHR2Q16671 573 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LONRF3Q496Y0 759 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 UBXN11Q5T124 520 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CALML4Q96GE6 196 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CPB2Q96IY4 423 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT74Q96LB3 600 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 USP28Q96RU2 1077 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 COL4A6Q14031 1691 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NAMPTP43490 491 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R5AQ15172 486 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPROQ16827 1216 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HELQQ8TDG4 1101 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LPPQ93052 612 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PGBD4Q96DM1 585 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CSRNP2Q9H175 543 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CWH43Q9H720 699 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G4BP0C869 781 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC39A14Q15043 492 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NOTUMQ6P988 496 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 DEPTORQ8TB45 409 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 P2RX5Q93086 422 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 FZD8Q9H461 694 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 AAASQ9NRG9 546 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GRM6O15303 877 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 B4GALT5O43286 388 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HIP1RO75146 1068 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC12A3P55017 1021 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SPECC1Q5M775 1068 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HCSTQ9UBK5 93 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 OFD1O75665 1012 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM187BQ17R55 369 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 DAW1Q8N136 415 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC51Q96ER9 411 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 EPSTI1Q96J88 318 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIC6Q96NY7 704 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TIPINQ9BVW5 301 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 EYSQ5T1H1 3165 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms