RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413658.6

ZNF3-205, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 1,441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-205	ENST00000413658	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PLS3	P13797	630 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CSF2RA	P15509	400 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	MCM4	P33991	863 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	NAMPT	P43490	491 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	NPTX2	P47972	431 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PTEN	P60484	403 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	AMPD3	Q01432	767 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	EHHADH	Q08426	723 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CUL4B	Q13620	913 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	IER5L	Q5T953	404 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	RNF149	Q8NC42	400 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658		H0YGN5	161 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658		M0QZ92	97 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GHR	P10912	638 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	RFC2	P35250	354 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	EPHB4	P54760	987 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PEX3	P56589	373 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	DPYD	Q12882	1025 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	KCNN1	Q92952	543 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PARVG	Q9HBI0	331 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GINS2	Q9Y248	185 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TTC3	P53804	2025 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	FAM13A	O94988	1023 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	MYL1	P05976	194 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PHKA2	P46019	1235 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	ASIC1	P78348	528 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TFDP1	Q14186	410 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	AMHR2	Q16671	573 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	STRA6	Q9BX79	667 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	SLC16A4	O15374	487 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	EDN1	P05305	212 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	GAP43	P17677	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	FGFR4	P22455	802 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	CD52	P31358	61 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	FPGS	Q05932	587 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	COASY	Q13057	564 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59	2e-9	■□□□□ 8
ZNF3-205	ENST00000413658	PNOC	Q13519	176 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	POSTN	Q15063	836 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	FAM187B	Q17R55	369 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-205	ENST00000413658	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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