RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 FNTAP49354 379 aa21.55■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 SCFD2Q8WU76 684 aa21.55■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 17.6
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PAN3-201ENST00000380958 SPDYE6P0CI01 402 aa21.54■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.54■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 STK33Q9BYT3 514 aa21.54■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.54■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 RIT2Q99578 217 aa21.53■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 VCPKMTQ9H867 229 aa21.53■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 104.5
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PAN3-201ENST00000380958 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 FIZ1Q96SL8 496 aa21.53■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.53■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 NFS1Q9Y697 457 aa21.53■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.52■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 MSL1Q68DK7 614 aa21.52■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 CCDC188H7C350 402 aa21.52■■□□□ 1.04
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PAN3-201ENST00000380958 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.52■■□□□ 1.04
PAN3-201ENST00000380958 F8VZ95 297 aa21.51■■□□□ 1.03
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PAN3-201ENST00000380958 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ACER1Q8TDN7 264 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 GLG1Q92896 1179 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 CCDC114Q96M63 670 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 YDJCA8MPS7 323 aa21.51■■□□□ 1.03
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PAN3-201ENST00000380958 BCRP11274 1271 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ELF1P32519 619 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 CUL1Q13616 776 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 LLGL1Q15334 1064 aa21.51■■□□□ 1.03
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PAN3-201ENST00000380958 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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PAN3-201ENST00000380958 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.51■■□□□ 1.03
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PAN3-201ENST00000380958 CCDC174Q6PII3 467 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.51■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 NCANO14594 1321 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ZBTB39O15060 712 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ODR4Q5SWX8 454 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 EVI5O60447 810 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.5■■□□□ 1.03
PAN3-201ENST00000380958 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.5■■□□□ 1.03
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