RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373198.8

PTPRT-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRT, Length 12,746 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-206ENST00000373198 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 V9GYQ6 96 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 M0QYV0 167 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 ARL4CP56559 192 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 ACAP3Q96P50 834 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 STMN3Q9NZ72 180 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 NESP48681 1621 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-206ENST00000373198 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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PTPRT-206ENST00000373198 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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PTPRT-206ENST00000373198 SOX13Q9UN79 622 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRT-206ENST00000373198 EPHB4P54760 987 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-206ENST00000373198 CENPPQ6IPU0 288 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-206ENST00000373198 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-206ENST00000373198 MUC3BQ9H195 1237 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-206ENST00000373198 RERGLQ9H628 205 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-206ENST00000373198 CCDC78A2IDD5 438 aa9.58□□□□□ -0.88
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