RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RNF19AQ9NV58 838 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MYH11P35749 1972 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DGAT1O75907 488 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 EOMESO95936 686 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 LAG3P18627 525 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB1P25685 340 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TECP42680 631 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PHKA2P46019 1235 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RARRES1P49788 294 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RAB27AP51159 221 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CAMK1Q14012 370 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 COL19A1Q14993 1142 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF174Q15697 407 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FERMT3Q86UX7 667 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RNF149Q8NC42 400 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ERMNQ8TAM6 284 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 HELQQ8TDG4 1101 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CASD1Q96PB1 797 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CWH43Q9H720 699 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CLDND1Q9NY35 253 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ASAP2O43150 1006 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NCK2O43639 380 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MED24O75448 989 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 FGF18O76093 207 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SKIP12755 728 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PDCP20941 246 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1AP35813 382 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 UBE3AQ05086 875 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 HYAL1Q12794 435 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TFDP1Q14186 410 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 POTEGQ6S5H5 508 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 HSCBQ8IWL3 235 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 POF1BQ8WVV4 589 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LPPQ93052 612 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SNX21Q969T3 373 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TLR9Q9NR96 1032 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WWV3 80 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ERLIN2O94905 339 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RPA1P27694 616 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GJB2P29033 226 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 IRS1P35568 1242 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PBX3P40426 434 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PTENP60484 403 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PTGDRQ13258 359 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CAPSQ13938 189 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LONRF3Q496Y0 759 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MCTP1Q6DN14 999 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF558Q96NG5 402 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NACC1Q96RE7 527 aa8.51□□□□□ -1.05
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