RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.9■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 CLLU1OSQ5K130 101 aa29.9■■■□□ 2.38
TPGS1-201ENST00000359315 UBXN11Q5T124 520 aa29.9■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TPGS1-201ENST00000359315 CPB2Q96IY4 423 aa29.9■■■□□ 2.38
TPGS1-201ENST00000359315 DACT1Q9NYF0 836 aa29.9■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 F13A1P00488 732 aa29.89■■■□□ 2.38
TPGS1-201ENST00000359315 CTNNB1P35222 781 aa29.89■■■□□ 2.38
TPGS1-201ENST00000359315 UBA7P41226 1012 aa29.89■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 TRAIPQ9BWF2 469 aa29.89■■■□□ 2.38
TPGS1-201ENST00000359315 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.89■■■□□ 2.38
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC39A14Q15043 492 aa29.88■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 MICALL1Q8N3F8 863 aa29.88■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 NT5C3AQ9H0P0 336 aa29.88■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.88■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G4BP0C869 781 aa29.87■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 PLCG1P19174 1290 aa29.87■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 SLC12A3P55017 1021 aa29.87■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 USP20Q9Y2K6 914 aa29.87■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 COL6A3P12111 3177 aa29.87■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.86■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.85■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 C5orf67F2Z3F1 127 aa29.84■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 H3BNC9 293 aa29.84■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.84■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM6Q9NQX0 595 aa29.84■■■□□ 2.37
TPGS1-201ENST00000359315 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 SFI1A8K8P3 1242 aa29.83■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 GUCY2CP25092 1073 aa29.83■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 STK38Q15208 465 aa29.83■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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TPGS1-201ENST00000359315 EYSQ5T1H1 3165 aa29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF623O75123 536 aa29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PEX3P56589 373 aa29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 MCM6Q14566 821 aa29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD17Q8N5Z5 321 aa29.82■■■□□ 2.36
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