RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ASAP2O43150 1006 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP7D2Q96T17 732 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 GNA14O95837 355 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 STRN3Q13033 797 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF180Q86T96 592 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C7orf31Q8N865 590 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF149Q8NC42 400 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CLIC2O15247 247 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC25BP30305 580 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 EFNA5P52803 228 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 AKT3Q9Y243 479 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GTH6 734 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 K7ERI5 159 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ASGR1P07306 291 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TPM2P07951 284 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 GJB1P08034 283 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAT1P11488 350 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNA10Q16322 511 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP4Q96MN2 994 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MYBPC2Q14324 1141 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 DRC7Q8IY82 874 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 BICD1Q96G01 975 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 N4BP3O15049 544 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXC8P31273 242 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM17P78536 824 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS16Q9H269 839 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 VTNP04004 478 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PHKA2P46019 1235 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2J2P51589 502 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 POU5F1BQ06416 359 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP135Q66GS9 1140 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS13Q9NVM9 706 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 DMAC2Q9NW81 257 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TISP43B9A030 160 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2C9P11712 490 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LIG4P49917 911 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PTENP60484 403 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NR1I3Q14994 352 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK6Q16659 721 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LHX8Q68G74 356 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CABYRO75952 493 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP3O75969 853 aa22.68■■□□□ 1.22
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