RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRB-201ENST00000261266 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRB-201ENST00000261266 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRB-201ENST00000261266 CLCN6P51797 869 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRB-201ENST00000261266 NFU1Q9UMS0 254 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 PLAAQ9Y263 795 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 MEIS1O00470 390 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 CD4P01730 458 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 MYL3P08590 195 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 SRGNP10124 158 aa9.62□□□□□ -0.87
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