RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 KSR1Q8IVT5 923 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 USP38Q8NB14 1042 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 BSNDQ8WZ55 320 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 EXOC1Q9NV70 894 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SQORQ9Y6N5 450 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WZ62 844 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GLRA2P23416 452 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 LPIN1Q14693 890 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GPNMBQ14956 572 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SFR1Q86XK3 245 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 MYCT1Q8N699 235 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 RNF149Q8NC42 400 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 RPS6KA5O75582 802 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ACTN1P12814 892 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 EPHB4P54760 987 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ODR4Q5SWX8 454 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SEPT8Q92599 483 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 IFT74Q96LB3 600 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 FGBP02675 491 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PHKA2P46019 1235 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PEX3P56589 373 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PAK2Q13177 524 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PSMD2Q13200 908 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CAPSQ13938 189 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 MORC3Q14149 939 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PPP2R5AQ15172 486 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF365Q70YC5 407 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 FIZ1Q96SL8 496 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 FSD2A1L4K1 749 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 BIN1O00499 593 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CD52P31358 61 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NAMPTP43490 491 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM240Q5SV17 173 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 APBB2Q92870 758 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 HPS3Q969F9 1004 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 VWCEQ96DN2 955 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 BMP8BP34820 402 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NPTX2P47972 431 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NCKAP1LP55160 1127 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TSPY26PQ9H489 355 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GPR182O15218 404 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 BMP6P22004 513 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SMTNP53814 917 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 STK4Q13043 487 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ISM2Q6H9L7 571 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FAM228AQ86W67 206 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 PADI3Q9ULW8 664 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC169A6NNP5 214 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZBBXA8MT70 800 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms