RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HIP1RO75146 1068 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 MCM6Q14566 821 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 KIFAP3Q92845 792 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 A0A0U1RQF3 1178 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 LINC00271P0C7V0 271 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 SHC4Q6S5L8 630 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 FZD8Q9H461 694 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 RNF19AQ9NV58 838 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CFAP45Q9UL16 551 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.67■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN1O60635 241 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CUTAO60888 179 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 NAMPTP43490 491 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 GATMP50440 423 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 UBXN11Q5T124 520 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 YME1L1Q96TA2 773 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 EPOPA6NHQ4 379 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 SFI1A8K8P3 1242 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 EDN1P05305 212 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 STAG3L1P0CL83 205 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TIPINQ9BVW5 301 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PANK2Q9BZ23 570 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 KCND2Q9NZV8 630 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TRANK1O15050 2925 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 B4GALT5O43286 388 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 NPTX2P47972 431 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 FAM187BQ17R55 369 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CERS4Q9HA82 394 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 DACT1Q9NYF0 836 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-201ENST00000236273 ZNF623O75123 536 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-21P61565 698 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 GIT2Q14161 759 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 GPBP1Q86WP2 473 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CPB2Q96IY4 423 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 STK17AQ9UEE5 414 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 MYH11P35749 1972 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 FGFR1P11362 822 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 AXLP30530 894 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PEX3P56589 373 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R5AQ15172 486 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 E2F4Q16254 413 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 IFT74Q96LB3 600 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 DRC1Q96MC2 740 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 REEP2Q9BRK0 252 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 USP20Q9Y2K6 914 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 COL6A3P12111 3177 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 RFXAPO00287 272 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 EOMESO95936 686 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 NUCB2P80303 420 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CASD1Q96PB1 797 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GUA9 196 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ERLIN2O94905 339 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PLS3P13797 630 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 TXLNAP40222 546 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ME1P48163 572 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF131P52739 623 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms